Accuratezza di previsione

Dinesh Thekkoot, PhD

Università di Alberta e Genesus Inc.

L'obiettivo dell'allevamento animale è migliorare geneticamente le popolazioni. In altre parole, la prossima generazione dovrebbe essere superiore alla generazione attuale. La sfida è identificare i migliori animali per essere genitori della prossima generazione. Per identificare i futuri genitori dobbiamo conoscere il loro vero valore genetico (Walk Go Skechers TBV). Nella vita reale è impossibile osservare il TBV di un animale. Quindi utilizziamo una stima del TBV chiamata valore di allevamento stimato (Walk Skechers Go EBV). I genitori della prossima generazione sono selezionati in base ai loro EBV.

Una domanda importante è quanto una stima accurata è l'EBV del TBV? La precisione dell'EBV è definita come la correlazione tra valori riproduttivi reali e stimati. Questa correlazione dà un'idea di quanto sia vicino l'EBV al TBV. La precisione di EBV può variare da 0 (una stima imprecisa) a 1 (EBV è una stima perfetta di TBV). Maggiore è l'accuratezza EBV, minore è il rischio di selezionare animali con TBV basso come genitori. L'accuratezza EBV influenza anche il guadagno genetico da un programma di selezione. Il guadagno genetico in un programma di allevamento è proporzionale all'accuratezza dell'EBV. Maggiore è l'accuratezza di EBV senza cambiamenti in altri fattori, maggiore sarà il guadagno genetico dalla selezione.

Il guadagno genetico per anno è calcolato utilizzando la formula

Dov'è il guadagno genetico per anno, è l'intensità della selezione, è l'accuratezza EBV, è la deviazione standard genetica additiva del tratto sotto selezione ed è l'intervallo di generazione espresso in anni. Nella maggior parte dei programmi di riproduzione suina, l'intensità della selezione e dell'intervallo di generazione sono prossime all'ottimizzazione senza avere un effetto negativo sulla variazione genetica. Pertanto, per qualsiasi ulteriore aumento, è necessario introdurre metodi che possano aumentare l'accuratezza di EBV.

L'esattezza EBV dipende da molti fattori quali l'ereditarietà del tratto, la quantità e la qualità delle informazioni disponibili sul candidato e dei parenti della selezione, le relazioni genetiche tra tutti gli animali, ecc. In generale, maggiore è la quantità di informazioni disponibili, più elevata sarà la precisione EBV.

Accuratezza EBV utilizzando metodi diversi

  1. Migliore previsione lineare imparziale (BLUP) modello animale. Questo metodo è utilizzato oggi nella maggior parte dei programmi genetici e utilizza tutte le informazioni disponibili per calcolare gli EBV. Gli EBV sono stimati utilizzando fenotipi sui candidati di selezione e parenti insieme ai rapporti pedigree. Insieme alla previsione, i modelli animali BLUP correggono simultaneamente i fenotipi per gli effetti ambientali sistematici. Ad esempio, questo metodo rappresenta gli animali geneticamente connessi in diverse aziende mentre sta valutando gli EBV. Questo è il metodo più preciso per la previsione di EBV utilizzando entrambi i pedigree e i fenotipi.
  2. Selezione genomica (GSBorsa Donna A Spalla Pierre Cardin Avorio Con Apertura Zip Vn1808). I giovani animali che non hanno il proprio fenotipo avranno bassi precisioni EBV utilizzando i metodi di modello animale BLUP. A seconda del tratto, potrebbe richiedere una considerevole quantità di tempo per ottenere un proprio fenotipo o alcuni animali potrebbero non avere mai un proprio fenotipo. Ad esempio, ci vogliono circa i mesi 12 per ottenere informazioni sugli scarti su un dorato e sugli animali selezionati poiché i genitori non potranno mai ottenere i fenotipi di carcassa e qualità della carne. Quindi sarebbe bene se possiamo aumentare le precisioni EBV per questi tipi di tratti. La previsione genomica è un metodo recentemente sviluppato per affrontare questo problema. Predice gli EBV usando le informazioni del marcatore molecolare con precisione senza la necessità di un proprio fenotipo. Studi sono stati condotti a Genesus e altrove, per stimare le precisioni usando GS. I risultati mostrano che per un gran numero di caratteristiche le precisioni di GS sono superiori ai metodi BLUP basati su fenotipi e informazioni pedigree.
  3. La combinazione di informazioni genomiche, fenotipiche e pedigree può determinare maggiore precisione rispetto a GS. Single Step BLUP genomico (SSBLUP) è il metodo che combina queste tre fonti di informazioni. Attualmente questo metodo fornisce le più alte precisione EBV per i giovani animali. Gli studi condotti a Genesus hanno dimostrato che le SSBUP EBV accuracies erano intorno a 30-50% superiore a EBUP basati su BLUP. Una maggiore precisione di previsione significa un cambiamento genetico maggiore all'anno.

Skechers Walk Go Accuratezza degli EBV e cambiamento genetico previsto per la selezione di alcuni tratti utilizzando due metodi diversi

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Tratti

Deviazione standard genetica

BLUP

SSBLUP

Precisione

Cambi genetici / annoWalk Go Skechers *

Precisione

Cambi genetici / anno*

Totale nato

1.15

0.31

0.63

0.42

0.85

Go Walk Skechers Svuotare il grasso indietro nel farrowing (mm)

Walk Go Skechers Walk Go Skechers 2.49

0.36

1.57

0.53

2.32

Sfruttare il peso corporeo al grasso (kg)

8.61

Skechers Walk Go 0.32

4.84

0.40

6.04

*Assumendo una proporzione di selezione di 10% e intervallo di generazione di anno 1 per tutti i tratti e per entrambi i metodi

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Come si può vedere nella tabella precedente, l'accuratezza dell'EBV e la conseguente variazione genetica all'anno sono aumentate con l'aggiunta di informazioni genomiche (BLUP rispetto a SSBLUP) per tutti e tre i tratti. Chiaramente l'impatto delle informazioni genomiche sul cambiamento genetico per anno è significativo. A Genesus produciamo i più precisi EBV per i nostri candidati alla selezione. Abbiamo investito pesantemente per raccogliere informazioni accurate e aggiornate su tutti i tratti di crescita, efficienza, riproduzione, carcassa e qualità della carne, per tutti gli animali presenti nel nucleo, moltiplicatore e mandrie di produzione. Questi dati di alta qualità e informazioni genomiche ci aiutano a stimare i possibili EBV più precisi, assicurando la massima risposta genetica e la massima redditività per i clienti di Genesus.

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Questo post è stato scritto da Genesus