Accuratezza di previsione

Dinesh Thekkoot, PhD

Università di Alberta e Genesus Inc.

L'obiettivo dell'allevamento animale è migliorare geneticamente le popolazioni. In altre parole, la prossima generazione dovrebbe essere superiore alla generazione attuale. La sfida è identificare i migliori animali per essere genitori della prossima generazione. Per identificare i futuri genitori dobbiamo conoscere il loro vero valore genetico (069 reliure marron cuivre Paquetage Mano A Marrone Bg Borsa Donna TBV). Nella vita reale è impossibile osservare il TBV di un animale. Quindi utilizziamo una stima del TBV chiamata valore di allevamento stimato (marron cuivre Bg 069 Marrone Mano Paquetage reliure A Borsa Donna EBV). I genitori della prossima generazione sono selezionati in base ai loro EBV.

Una domanda importante è quanto una stima accurata è l'EBV del TBV? La precisione dell'EBV è definita come la correlazione tra valori riproduttivi reali e stimati. Questa correlazione dà un'idea di quanto sia vicino l'EBV al TBV. La precisione di EBV può variare da 0 (una stima imprecisa) a 1 (EBV è una stima perfetta di TBV). Maggiore è l'accuratezza EBV, minore è il rischio di selezionare animali con TBV basso come genitori. L'accuratezza EBV influenza anche il guadagno genetico da un programma di selezione. Il guadagno genetico in un programma di allevamento è proporzionale all'accuratezza dell'EBV. Maggiore è l'accuratezza di EBV senza cambiamenti in altri fattori, maggiore sarà il guadagno genetico dalla selezione.

Il guadagno genetico per anno è calcolato utilizzando la formula

Dov'è il guadagno genetico per anno, è l'intensità della selezione, è l'accuratezza EBV, è la deviazione standard genetica additiva del tratto sotto selezione ed è l'intervallo di generazione espresso in anni. Nella maggior parte dei programmi di riproduzione suina, l'intensità della selezione e dell'intervallo di generazione sono prossime all'ottimizzazione senza avere un effetto negativo sulla variazione genetica. Pertanto, per qualsiasi ulteriore aumento, è necessario introdurre metodi che possano aumentare l'accuratezza di EBV.

L'esattezza EBV dipende da molti fattori quali l'ereditarietà del tratto, la quantità e la qualità delle informazioni disponibili sul candidato e dei parenti della selezione, le relazioni genetiche tra tutti gli animali, ecc. In generale, maggiore è la quantità di informazioni disponibili, più elevata sarà la precisione EBV.

Accuratezza EBV utilizzando metodi diversi

  1. Migliore previsione lineare imparziale (BLUP) modello animale. Questo metodo è utilizzato oggi nella maggior parte dei programmi genetici e utilizza tutte le informazioni disponibili per calcolare gli EBV. Gli EBV sono stimati utilizzando fenotipi sui candidati di selezione e parenti insieme ai rapporti pedigree. Insieme alla previsione, i modelli animali BLUP correggono simultaneamente i fenotipi per gli effetti ambientali sistematici. Ad esempio, questo metodo rappresenta gli animali geneticamente connessi in diverse aziende mentre sta valutando gli EBV. Questo è il metodo più preciso per la previsione di EBV utilizzando entrambi i pedigree e i fenotipi.
  2. Selezione genomica (GSRed Wing Mens Postman Oxford 3118 Leather Shoes Copper). I giovani animali che non hanno il proprio fenotipo avranno bassi precisioni EBV utilizzando i metodi di modello animale BLUP. A seconda del tratto, potrebbe richiedere una considerevole quantità di tempo per ottenere un proprio fenotipo o alcuni animali potrebbero non avere mai un proprio fenotipo. Ad esempio, ci vogliono circa i mesi 12 per ottenere informazioni sugli scarti su un dorato e sugli animali selezionati poiché i genitori non potranno mai ottenere i fenotipi di carcassa e qualità della carne. Quindi sarebbe bene se possiamo aumentare le precisioni EBV per questi tipi di tratti. La previsione genomica è un metodo recentemente sviluppato per affrontare questo problema. Predice gli EBV usando le informazioni del marcatore molecolare con precisione senza la necessità di un proprio fenotipo. Studi sono stati condotti a Genesus e altrove, per stimare le precisioni usando GS. I risultati mostrano che per un gran numero di caratteristiche le precisioni di GS sono superiori ai metodi BLUP basati su fenotipi e informazioni pedigree.
  3. La combinazione di informazioni genomiche, fenotipiche e pedigree può determinare maggiore precisione rispetto a GS. Single Step BLUP genomico (SSBLUP) è il metodo che combina queste tre fonti di informazioni. Attualmente questo metodo fornisce le più alte precisione EBV per i giovani animali. Gli studi condotti a Genesus hanno dimostrato che le SSBUP EBV accuracies erano intorno a 30-50% superiore a EBUP basati su BLUP. Una maggiore precisione di previsione significa un cambiamento genetico maggiore all'anno.

reliure Donna Marrone marron 069 Borsa cuivre Mano Bg A Paquetage Accuratezza degli EBV e cambiamento genetico previsto per la selezione di alcuni tratti utilizzando due metodi diversi

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Tratti

Deviazione standard genetica

BLUP

SSBLUP

Precisione

Cambi genetici / annoreliure marron cuivre Marrone Borsa Donna Bg Paquetage A Mano 069 *

Precisione

Cambi genetici / anno*

Totale nato

1.15

0.31

0.63

0.42

0.85

Bg A reliure Paquetage cuivre marron 069 Borsa Donna Marrone Mano Svuotare il grasso indietro nel farrowing (mm)

Bg Paquetage Mano Borsa reliure marron cuivre A 069 Donna Marrone Paquetage Borsa Donna cuivre A Bg marron Marrone reliure Mano 069 2.49

0.36

1.57

0.53

2.32

Sfruttare il peso corporeo al grasso (kg)

8.61

Paquetage Mano 069 Donna Marrone Bg Borsa cuivre A marron reliure 0.32

4.84

0.40

6.04

*Assumendo una proporzione di selezione di 10% e intervallo di generazione di anno 1 per tutti i tratti e per entrambi i metodi

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Come si può vedere nella tabella precedente, l'accuratezza dell'EBV e la conseguente variazione genetica all'anno sono aumentate con l'aggiunta di informazioni genomiche (BLUP rispetto a SSBLUP) per tutti e tre i tratti. Chiaramente l'impatto delle informazioni genomiche sul cambiamento genetico per anno è significativo. A Genesus produciamo i più precisi EBV per i nostri candidati alla selezione. Abbiamo investito pesantemente per raccogliere informazioni accurate e aggiornate su tutti i tratti di crescita, efficienza, riproduzione, carcassa e qualità della carne, per tutti gli animali presenti nel nucleo, moltiplicatore e mandrie di produzione. Questi dati di alta qualità e informazioni genomiche ci aiutano a stimare i possibili EBV più precisi, assicurando la massima risposta genetica e la massima redditività per i clienti di Genesus.

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Questo post è stato scritto da Genesus